Run 2

A second run with mutation rate MT=40 shows no significant difference.

Figure 10.5: Example gaw2 running on world W with l=12, n=4, N=280, MT=40
\includegraphics[width=4.5in]{gaw2_n4l12N280MT40_2.eps}

-->[POP]=popgen(n,l)
 POP  =
 
    1.    1.    0.    0.    0.    1.    1.    1.    0.    0.    1.    1.  
    0.    1.    0.    1.    1.    1.    0.    1.    0.    0.    0.    1.  
    1.    1.    0.    1.    1.    1.    1.    0.    1.    1.    1.    0.  
    0.    1.    0.    0.    0.    1.    1.    0.    0.    0.    1.    1.  
 
-->N=280, MT=round(N/7),b=2,show=2,[FITNESS_ALL_PERC,POP]=gaw2(W,POP,l,n,N,
MT,b,show)
 N  =
 
    280.  
 MT  =
 
    40.  
 b  =
 
    2.  
 show  =
 
    2.  
mutation point at row = 1 col = 1
Mutation at cycle = 42
mutation point at row = 1 col = 1
Mutation at cycle = 83
mutation point at row = 3 col = 4
Mutation at cycle = 124
mutation point at row = 2 col = 8
Mutation at cycle = 165
mutation point at row = 4 col = 4
Mutation at cycle = 206
mutation point at row = 3 col = 12
Mutation at cycle = 247
Number of Events n * N = 1120
 POP  =
 
 
         column  1 to 12
 
    1.    1.    0.    1.    0.    1.    1.    1.    1.    1.    1.    0.  
    1.    1.    0.    1.    0.    1.    1.    0.    1.    1.    1.    0.  
    1.    1.    0.    0.    1.    1.    1.    0.    1.    1.    1.    0.  
    1.    1.    0.    1.    1.    1.    1.    0.    1.    1.    1.    0.  
 
         column 13 to 21
 
    0.    26.    0.25         1.           1.    0.    0.    1.    1.  
    0.    27.    0.2596154    1.0384615    1.    0.    0.    1.    1.  
    0.    24.    0.2307692    0.9230769    1.    0.    0.    1.    1.  
    0.    27.    0.2596154    1.0384615    1.    0.    0.    1.    1.  
 
         column 22 to 31
 
    0.    1.    0.    1.    1.    1.    1.    1.    1.    0.  
    0.    1.    1.    1.    1.    0.    1.    1.    1.    0.  
    0.    0.    1.    1.    1.    0.    1.    1.    1.    0.  
    0.    1.    0.    1.    1.    0.    1.    1.    1.    0.  
 FITNESS_ALL_PERC  =
 
    30.        
    41.666667  
    46.666667  
    30.        
    32.916667  
    44.166667  
    45.833333  
    56.25      
    50.        
    51.666667  
    49.166667  
    52.5       
    43.333333  
    44.583333  
    49.583333  
    52.5       
    56.666667  
    54.166667  
    52.083333  
    50.833333  
    56.666667  
    51.666667  
    55.        
    51.25      
    48.75      
    43.333333  
    55.416667  
    49.166667  
    51.25      
    48.333333  
    47.5       
    54.166667  
    45.833333  
    45.833333  
    52.083333  
    51.666667  
    45.        
    52.916667  
    48.75      
    47.083333  
    57.5       
    47.916667  
    55.833333  
    55.833333  
    51.25      
    48.333333  
    52.5       
    46.666667  
    49.166667  
    50.416667  
    50.416667  
    50.416667  
    57.083333  
    56.25      
    49.166667  
    50.        
    51.666667  
    47.916667  
    55.        
    50.416667  
    49.583333  
    49.166667  
    50.        
    46.666667  
    53.75      
    52.916667  
    45.416667  
    47.5       
    49.166667  
    47.916667  
    47.5       
    55.416667  
    49.166667  
    58.75      
    50.        
    52.083333  
    51.25      
    49.166667  
    45.833333  
    55.        
    48.333333  
    49.166667  
    43.75      
    53.75      
    45.416667  
    50.833333  
    47.916667  
    55.        
    47.916667  
    49.166667  
    46.666667  
    54.583333  
    48.75      
    53.333333  
    54.583333  
    50.833333  
    50.416667  
    49.583333  
    49.583333  
    47.083333  
    48.75      
    48.333333  
    45.        
    48.333333  
    51.666667  
    50.        
    53.75      
    45.        
    45.416667  
    50.        
    46.666667  
    46.666667  
    48.75      
    55.416667  
    47.5       
    51.25      
    55.        
    46.666667  
    51.25      
    50.833333  
    51.666667  
    45.        
    45.833333  
    54.583333  
    48.75      
    54.583333  
    48.333333  
    48.75      
    46.25      
    50.833333  
    46.666667  
    50.416667  
    53.75      
    48.75      
    43.75      
    53.333333  
    51.25      
    54.583333  
    57.083333  
    53.333333  
    49.166667  
    52.916667  
    44.583333  
    56.666667  
    58.333333  
    53.333333  
    51.25      
    54.583333  
    50.        
    47.083333  
    47.083333  
    50.416667  
    47.916667  
    51.25      
    47.083333  
    49.166667  
    50.416667  
    57.083333  
    55.833333  
    51.25      
    51.666667  
    48.333333  
    50.        
    57.916667  
    51.666667  
    45.833333  
    44.583333  
    45.416667  
    46.25      
    45.        
    48.75      
    50.833333  
    51.25      
    51.25      
    50.416667  
    52.083333  
    59.166667  
    43.333333  
    54.166667  
    52.083333  
    56.25      
    54.166667  
    51.25      
    45.833333  
    54.166667  
    49.166667  
    50.416667  
    50.        
    56.25      
    57.5       
    47.083333  
    51.666667  
    46.666667  
    44.583333  
    49.166667  
    50.833333  
    50.        
    52.916667  
    53.333333  
    48.75      
    47.083333  
    51.666667  
    47.5       
    41.666667  
    41.25      
    50.416667  
    45.        
    47.083333  
    49.583333  
    50.833333  
    50.        
    50.416667  
    48.75      
    51.666667  
    48.333333  
    47.916667  
    48.333333  
    45.        
    53.333333  
    54.583333  
    46.25      
    55.        
    53.333333  
    55.416667  
    52.083333  
    52.083333  
    52.083333  
    48.75      
    54.166667  
    53.75      
    49.166667  
    50.        
    44.583333  
    47.5       
    48.75      
    47.916667  
    49.583333  
    49.583333  
    51.666667  
    47.916667  
    49.583333  
    53.75      
    47.5       
    52.5       
    52.083333  
    47.083333  
    43.333333  
    48.333333  
    46.25      
    50.        
    45.        
    47.5       
    48.333333  
    49.166667  
    49.583333  
    54.166667  
    55.833333  
    45.833333  
    50.833333  
    39.583333  
    53.75      
    47.916667  
    50.833333  
    51.666667  
    56.666667  
    47.083333  
    49.583333  
    55.833333  
    49.166667  
    51.666667  
    55.833333  
    54.583333  
    51.666667  
    50.        
    50.833333  
    47.916667  
    46.666667  
    47.5       
    52.083333  
    43.333333



Gerd Doeben-Henisch 2012-03-31