Run1

Figure 10.4 shows a run with no mutation on the same world W as in the preceding examples, but in this case with all pairs encoded in one genome.

The direct comparison between Run2 of the non integrated genome case and this Run1 with the integrated genome case (but still without mutation) reveals the the integrated case is more 'stable' centering around a mean value.

Figure 10.4: Example gaw2 running on world W with l=12, n=4, N=280, MT=0
\includegraphics[width=4.5in]{gaw2_n4l12N280MT0_1.eps}

-->n=4, l=12
  
-->[POP]=popgen(n,l)
 POP  =
 
    1.    1.    0.    1.    0.    0.    1.    0.    1.    1.    0.    0.  
    1.    1.    1.    0.    1.    0.    1.    1.    1.    0.    0.    0.  
    1.    1.    1.    1.    0.    1.    0.    0.    1.    0.    0.    1.  
    1.    1.    1.    1.    0.    1.    0.    0.    0.    1.    1.    0.  
 
-->W
 W  =
 
    1.    3.  
    2.    1.  
    3.    2.  
 
-->N=280, MT=N+1,b=2,show=2,[FITNESS_ALL_PERC,POP]=gaw2(W,POP,l,n,N, MT,b,show)

  
Number of Events n * N = 1120
 POP  =
 
         column  1 to 12
 
    1.    1.    1.    1.    0.    1.    1.    0.    1.    1.    1.    0.  
    1.    1.    1.    1.    0.    0.    0.    0.    1.    1.    1.    0.  
    1.    1.    1.    1.    0.    1.    0.    0.    1.    1.    1.    0.  
    1.    1.    1.    1.    0.    1.    0.    0.    1.    1.    1.    0.  
 
         column 13 to 21
 
    0.    30.    0.2586207    1.0344828    1.    0.    0.    1.    1.  
    0.    31.    0.2672414    1.0689655    1.    0.    0.    1.    1.  
    0.    29.    0.25         1.           1.    0.    0.    1.    1.  
    0.    26.    0.2241379    0.8965517    1.    0.    0.    1.    1.  
 
         column 22 to 31
 
    1.    1.    0.    1.    0.    0.    1.    1.    1.    0.  
    1.    1.    0.    1.    1.    0.    1.    1.    1.    0.  
    1.    1.    0.    1.    0.    0.    1.    1.    1.    0.  
    1.    1.    0.    0.    0.    0.    1.    1.    1.    0.  
 FITNESS_ALL_PERC  =
 
    27.5       
    26.666667  
    33.333333  
    39.166667  
    39.166667  
    35.833333  
    40.833333  
    39.166667  
    39.166667  
    36.666667  
    46.25      
    47.916667  
    52.5       
    51.25      
    47.083333  
    50.416667  
    45.833333  
    49.583333  
    50.416667  
    44.583333  
    49.583333  
    48.333333  
    49.166667  
    48.333333  
    47.5       
    48.75      
    44.166667  
    49.583333  
    50.416667  
    51.666667  
    53.333333  
    51.666667  
    46.25      
    49.583333  
    52.083333  
    55.833333  
    47.083333  
    50.833333  
    54.583333  
    52.916667  
    51.666667  
    50.416667  
    47.916667  
    44.166667  
    55.416667  
    45.833333  
    50.833333  
    49.166667  
    46.666667  
    50.833333  
    57.083333  
    53.333333  
    52.916667  
    46.666667  
    49.166667  
    48.75      
    47.5       
    51.666667  
    45.416667  
    50.        
    45.416667  
    50.416667  
    51.25      
    49.166667  
    47.5       
    48.333333  
    47.083333  
    51.25      
    46.666667  
    50.833333  
    50.416667  
    48.333333  
    49.583333  
    54.166667  
    49.166667  
    45.        
    50.833333  
    49.583333  
    52.916667  
    50.        
    55.833333  
    49.583333  
    51.666667  
    50.833333  
    46.666667  
    56.666667  
    50.416667  
    54.583333  
    48.75      
    48.75      
    55.416667  
    51.25      
    50.        
    50.416667  
    52.083333  
    50.833333  
    52.916667  
    55.833333  
    45.833333  
    48.75      
    50.        
    50.416667  
    46.25      
    49.583333  
    52.083333  
    51.25      
    48.75      
    50.416667  
    47.5       
    48.333333  
    46.25      
    55.        
    52.083333  
    49.583333  
    47.916667  
    50.833333  
    50.416667  
    50.        
    47.916667  
    48.333333  
    52.083333  
    47.5       
    55.416667  
    49.583333  
    49.583333  
    46.25      
    45.416667  
    55.        
    49.583333  
    43.75      
    46.25      
    48.75      
    49.583333  
    48.75      
    50.        
    48.333333  
    50.833333  
    46.666667  
    45.        
    53.333333  
    48.333333  
    48.333333  
    51.666667  
    52.083333  
    46.25      
    49.583333  
    50.416667  
    46.666667  
    47.916667  
    47.5       
    47.5       
    42.916667  
    44.583333  
    47.916667  
    48.333333  
    46.25      
    49.166667  
    51.666667  
    51.25      
    51.25      
    47.5       
    48.333333  
    51.25      
    49.583333  
    48.333333  
    45.        
    51.25      
    48.333333  
    51.666667  
    52.5       
    47.916667  
    48.333333  
    54.166667  
    47.5       
    43.333333  
    47.083333  
    53.75      
    50.        
    50.833333  
    49.583333  
    53.333333  
    47.083333  
    53.333333  
    54.166667  
    50.833333  
    50.        
    49.583333  
    47.916667  
    48.333333  
    48.333333  
    47.916667  
    50.        
    45.        
    48.75      
    47.083333  
    49.583333  
    52.916667  
    53.333333  
    45.833333  
    47.916667  
    50.        
    50.416667  
    52.916667  
    49.583333  
    45.416667  
    51.25      
    54.583333  
    50.833333  
    50.416667  
    54.166667  
    49.583333  
    49.583333  
    51.25      
    52.5       
    42.916667  
    51.666667  
    52.083333  
    46.25      
    52.5       
    49.166667  
    48.333333  
    54.166667  
    47.5       
    55.        
    47.916667  
    53.75      
    50.        
    46.25      
    48.75      
    49.166667  
    49.583333  
    50.416667  
    49.166667  
    55.        
    48.333333  
    49.583333  
    45.416667  
    56.25      
    52.083333  
    47.916667  
    45.416667  
    46.666667  
    47.5       
    55.833333  
    52.083333  
    46.666667  
    55.        
    47.083333  
    44.166667  
    52.916667  
    51.25      
    52.5       
    50.833333  
    49.583333  
    52.083333  
    47.083333  
    49.583333  
    46.25      
    49.583333  
    47.5       
    48.75      
    44.166667  
    52.916667  
    51.25      
    48.75      
    57.5       
    46.25      
    46.666667  
    46.25      
    50.        
    50.        
    45.416667  
    47.083333  
    53.75      
    49.583333  
    50.833333  
    45.416667  
    47.916667  
    48.75      
    48.333333



Gerd Doeben-Henisch 2012-03-31